Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALMO75781 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALMO75781 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALMO75781 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALMO75781 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALMO75781 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALMO75781 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALMO75781 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALMO75781 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALMO75781 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALMO75781 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALMO75781 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALMO75781 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALMO75781 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALMO75781 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALMO75781 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALMO75781 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PALMO75781 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALMO75781 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALMO75781 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALMO75781 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALMO75781 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALMO75781 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALMO75781 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALMO75781 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALMO75781 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALMO75781 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALMO75781 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALMO75781 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALMO75781 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALMO75781 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALMO75781 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALMO75781 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PALMO75781 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALMO75781 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALMO75781 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALMO75781 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALMO75781 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALMO75781 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALMO75781 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALMO75781 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALMO75781 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALMO75781 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PALMO75781 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALMO75781 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALMO75781 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALMO75781 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALMO75781 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALMO75781 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALMO75781 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALMO75781 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALMO75781 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALMO75781 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALMO75781 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALMO75781 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALMO75781 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALMO75781 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALMO75781 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALMO75781 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALMO75781 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALMO75781 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALMO75781 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALMO75781 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALMO75781 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALMO75781 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALMO75781 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALMO75781 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALMO75781 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALMO75781 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALMO75781 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALMO75781 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALMO75781 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALMO75781 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALMO75781 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALMO75781 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALMO75781 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PALMO75781 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PALMO75781 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PALMO75781 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALMO75781 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALMO75781 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALMO75781 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PALMO75781 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALMO75781 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALMO75781 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALMO75781 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALMO75781 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALMO75781 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALMO75781 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALMO75781 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PALMO75781 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALMO75781 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALMO75781 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALMO75781 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALMO75781 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALMO75781 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALMO75781 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALMO75781 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALMO75781 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALMO75781 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms