Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM3O75607 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM3O75607 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM3O75607 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM3O75607 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM3O75607 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM3O75607 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM3O75607 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM3O75607 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM3O75607 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM3O75607 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM3O75607 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM3O75607 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM3O75607 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM3O75607 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM3O75607 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM3O75607 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM3O75607 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM3O75607 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM3O75607 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM3O75607 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM3O75607 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM3O75607 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM3O75607 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM3O75607 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM3O75607 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM3O75607 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPM3O75607 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NPM3O75607 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NPM3O75607 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NPM3O75607 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM3O75607 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM3O75607 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM3O75607 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM3O75607 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NPM3O75607 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM3O75607 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM3O75607 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM3O75607 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM3O75607 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM3O75607 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NPM3O75607 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM3O75607 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM3O75607 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM3O75607 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM3O75607 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM3O75607 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM3O75607 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM3O75607 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM3O75607 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NPM3O75607 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM3O75607 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM3O75607 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM3O75607 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM3O75607 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NPM3O75607 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPM3O75607 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPM3O75607 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NPM3O75607 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM3O75607 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM3O75607 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM3O75607 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM3O75607 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NPM3O75607 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM3O75607 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM3O75607 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM3O75607 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM3O75607 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM3O75607 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NPM3O75607 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM3O75607 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM3O75607 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM3O75607 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM3O75607 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM3O75607 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NPM3O75607 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM3O75607 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM3O75607 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM3O75607 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM3O75607 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM3O75607 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NPM3O75607 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM3O75607 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM3O75607 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM3O75607 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM3O75607 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM3O75607 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM3O75607 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM3O75607 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NPM3O75607 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM3O75607 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM3O75607 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM3O75607 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM3O75607 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM3O75607 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NPM3O75607 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NPM3O75607 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPM3O75607 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPM3O75607 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NPM3O75607 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms