Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCM2O75603 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCM2O75603 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCM2O75603 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCM2O75603 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GCM2O75603 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCM2O75603 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCM2O75603 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCM2O75603 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCM2O75603 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCM2O75603 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GCM2O75603 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCM2O75603 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCM2O75603 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCM2O75603 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCM2O75603 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM2O75603 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM2O75603 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM2O75603 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM2O75603 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM2O75603 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM2O75603 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM2O75603 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM2O75603 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GCM2O75603 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCM2O75603 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCM2O75603 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCM2O75603 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCM2O75603 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GCM2O75603 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCM2O75603 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCM2O75603 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCM2O75603 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCM2O75603 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCM2O75603 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCM2O75603 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCM2O75603 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCM2O75603 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCM2O75603 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCM2O75603 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GCM2O75603 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCM2O75603 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCM2O75603 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCM2O75603 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCM2O75603 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GCM2O75603 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GCM2O75603 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCM2O75603 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCM2O75603 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCM2O75603 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCM2O75603 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCM2O75603 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCM2O75603 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCM2O75603 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCM2O75603 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCM2O75603 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCM2O75603 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCM2O75603 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCM2O75603 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCM2O75603 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCM2O75603 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCM2O75603 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCM2O75603 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCM2O75603 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCM2O75603 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GCM2O75603 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCM2O75603 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCM2O75603 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCM2O75603 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCM2O75603 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCM2O75603 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCM2O75603 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCM2O75603 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCM2O75603 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCM2O75603 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM2O75603 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM2O75603 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM2O75603 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM2O75603 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM2O75603 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM2O75603 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM2O75603 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM2O75603 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM2O75603 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM2O75603 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM2O75603 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCM2O75603 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCM2O75603 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCM2O75603 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCM2O75603 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCM2O75603 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCM2O75603 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCM2O75603 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCM2O75603 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms