Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA10O75578 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA10O75578 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA10O75578 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA10O75578 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms