Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BANF1O75531 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BANF1O75531 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BANF1O75531 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BANF1O75531 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BANF1O75531 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BANF1O75531 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BANF1O75531 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BANF1O75531 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BANF1O75531 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BANF1O75531 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BANF1O75531 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BANF1O75531 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BANF1O75531 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BANF1O75531 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BANF1O75531 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BANF1O75531 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BANF1O75531 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BANF1O75531 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BANF1O75531 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BANF1O75531 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BANF1O75531 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BANF1O75531 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BANF1O75531 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BANF1O75531 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BANF1O75531 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BANF1O75531 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BANF1O75531 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BANF1O75531 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BANF1O75531 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BANF1O75531 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BANF1O75531 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BANF1O75531 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BANF1O75531 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BANF1O75531 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BANF1O75531 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BANF1O75531 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BANF1O75531 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BANF1O75531 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BANF1O75531 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms