Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG13O75143 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG13O75143 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG13O75143 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG13O75143 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG13O75143 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG13O75143 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG13O75143 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG13O75143 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG13O75143 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG13O75143 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG13O75143 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG13O75143 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG13O75143 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG13O75143 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG13O75143 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG13O75143 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG13O75143 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG13O75143 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG13O75143 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG13O75143 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG13O75143 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG13O75143 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG13O75143 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG13O75143 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG13O75143 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG13O75143 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG13O75143 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG13O75143 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG13O75143 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG13O75143 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG13O75143 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG13O75143 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG13O75143 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG13O75143 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG13O75143 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG13O75143 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG13O75143 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG13O75143 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG13O75143 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG13O75143 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG13O75143 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG13O75143 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG13O75143 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG13O75143 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG13O75143 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG13O75143 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG13O75143 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG13O75143 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG13O75143 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG13O75143 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG13O75143 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG13O75143 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG13O75143 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG13O75143 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG13O75143 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG13O75143 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG13O75143 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG13O75143 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG13O75143 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG13O75143 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG13O75143 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG13O75143 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG13O75143 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG13O75143 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG13O75143 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG13O75143 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG13O75143 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG13O75143 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATG13O75143 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATG13O75143 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG13O75143 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG13O75143 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG13O75143 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG13O75143 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG13O75143 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG13O75143 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG13O75143 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG13O75143 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG13O75143 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG13O75143 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG13O75143 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG13O75143 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG13O75143 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG13O75143 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG13O75143 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG13O75143 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG13O75143 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG13O75143 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG13O75143 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG13O75143 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG13O75143 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG13O75143 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG13O75143 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG13O75143 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG13O75143 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG13O75143 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG13O75143 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG13O75143 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG13O75143 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms