Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KERAO60938 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KERAO60938 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KERAO60938 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KERAO60938 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KERAO60938 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KERAO60938 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KERAO60938 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KERAO60938 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KERAO60938 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KERAO60938 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KERAO60938 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KERAO60938 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KERAO60938 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KERAO60938 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KERAO60938 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KERAO60938 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KERAO60938 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KERAO60938 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KERAO60938 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KERAO60938 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KERAO60938 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KERAO60938 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KERAO60938 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KERAO60938 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KERAO60938 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KERAO60938 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KERAO60938 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KERAO60938 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KERAO60938 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KERAO60938 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KERAO60938 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KERAO60938 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KERAO60938 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KERAO60938 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KERAO60938 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KERAO60938 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KERAO60938 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KERAO60938 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KERAO60938 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KERAO60938 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KERAO60938 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KERAO60938 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KERAO60938 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KERAO60938 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KERAO60938 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KERAO60938 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KERAO60938 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KERAO60938 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KERAO60938 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KERAO60938 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KERAO60938 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KERAO60938 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KERAO60938 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KERAO60938 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KERAO60938 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KERAO60938 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms