Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD1O60671 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD1O60671 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD1O60671 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD1O60671 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD1O60671 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD1O60671 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD1O60671 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD1O60671 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD1O60671 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD1O60671 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD1O60671 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD1O60671 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD1O60671 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD1O60671 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD1O60671 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD1O60671 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD1O60671 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD1O60671 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD1O60671 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD1O60671 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD1O60671 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD1O60671 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD1O60671 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD1O60671 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD1O60671 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD1O60671 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD1O60671 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD1O60671 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD1O60671 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD1O60671 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD1O60671 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD1O60671 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD1O60671 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD1O60671 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD1O60671 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD1O60671 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD1O60671 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD1O60671 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD1O60671 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD1O60671 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD1O60671 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD1O60671 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD1O60671 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD1O60671 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD1O60671 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD1O60671 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD1O60671 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD1O60671 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD1O60671 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD1O60671 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD1O60671 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD1O60671 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD1O60671 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD1O60671 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD1O60671 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD1O60671 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD1O60671 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD1O60671 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD1O60671 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD1O60671 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD1O60671 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD1O60671 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD1O60671 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD1O60671 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD1O60671 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD1O60671 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD1O60671 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD1O60671 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD1O60671 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD1O60671 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD1O60671 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD1O60671 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD1O60671 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD1O60671 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD1O60671 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD1O60671 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD1O60671 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD1O60671 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD1O60671 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD1O60671 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD1O60671 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD1O60671 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD1O60671 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD1O60671 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD1O60671 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD1O60671 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD1O60671 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD1O60671 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD1O60671 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD1O60671 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD1O60671 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD1O60671 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD1O60671 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD1O60671 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD1O60671 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD1O60671 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD1O60671 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD1O60671 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAD1O60671 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms