Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRICKLE3O43900 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRICKLE3O43900 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE3O43900 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms