Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPOPO43791 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPOPO43791 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPOPO43791 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPOPO43791 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOPO43791 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOPO43791 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOPO43791 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOPO43791 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOPO43791 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPOPO43791 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPOPO43791 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPOPO43791 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPOPO43791 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPOPO43791 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPOPO43791 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOPO43791 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOPO43791 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOPO43791 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOPO43791 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOPO43791 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOPO43791 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOPO43791 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOPO43791 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOPO43791 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOPO43791 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOPO43791 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOPO43791 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOPO43791 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOPO43791 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOPO43791 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOPO43791 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOPO43791 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOPO43791 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOPO43791 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOPO43791 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOPO43791 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOPO43791 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOPO43791 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOPO43791 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOPO43791 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOPO43791 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOPO43791 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOPO43791 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOPO43791 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOPO43791 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOPO43791 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOPO43791 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOPO43791 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOPO43791 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOPO43791 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOPO43791 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOPO43791 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPOPO43791 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPOPO43791 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPOPO43791 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPOPO43791 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPOPO43791 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPOPO43791 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPOPO43791 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPOPO43791 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPOPO43791 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPOPO43791 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPOPO43791 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPOPO43791 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPOPO43791 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPOPO43791 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPOPO43791 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPOPO43791 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOPO43791 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOPO43791 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOPO43791 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOPO43791 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOPO43791 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOPO43791 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOPO43791 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOPO43791 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOPO43791 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOPO43791 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOPO43791 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOPO43791 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPOPO43791 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPOPO43791 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPOPO43791 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPOPO43791 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPOPO43791 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPOPO43791 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPOPO43791 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPOPO43791 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPOPO43791 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPOPO43791 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPOPO43791 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPOPO43791 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPOPO43791 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPOPO43791 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPOPO43791 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPOPO43791 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPOPO43791 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPOPO43791 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPOPO43791 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms