Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1O43719 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
HTATSF1O43719 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HTATSF1O43719 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HTATSF1O43719 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms