Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACTN4O43707 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN4O43707 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN4O43707 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms