Protein–RNA interactions for Protein: O43674

NDUFB5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB5O43674 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFB5O43674 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDUFB5O43674 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFB5O43674 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms