Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TNFSF14O43557 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNFSF14O43557 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNFSF14O43557 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms