Protein–RNA interactions for Protein: O43555

GNRH2, Progonadoliberin-2, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNRH2O43555 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GNRH2O43555 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GNRH2O43555 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms