Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUV39H1O43463 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUV39H1O43463 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUV39H1O43463 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUV39H1O43463 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUV39H1O43463 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUV39H1O43463 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUV39H1O43463 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms