Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBX1O43435 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX1O43435 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX1O43435 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX1O43435 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX1O43435 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX1O43435 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX1O43435 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBX1O43435 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX1O43435 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX1O43435 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX1O43435 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX1O43435 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX1O43435 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBX1O43435 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX1O43435 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX1O43435 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX1O43435 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX1O43435 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX1O43435 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX1O43435 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX1O43435 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBX1O43435 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX1O43435 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX1O43435 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX1O43435 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX1O43435 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX1O43435 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX1O43435 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX1O43435 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX1O43435 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX1O43435 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX1O43435 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBX1O43435 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TBX1O43435 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TBX1O43435 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX1O43435 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TBX1O43435 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX1O43435 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TBX1O43435 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX1O43435 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TBX1O43435 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TBX1O43435 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX1O43435 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX1O43435 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBX1O43435 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TBX1O43435 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX1O43435 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TBX1O43435 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TBX1O43435 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX1O43435 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX1O43435 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX1O43435 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX1O43435 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX1O43435 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBX1O43435 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX1O43435 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX1O43435 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX1O43435 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX1O43435 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX1O43435 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TBX1O43435 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX1O43435 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX1O43435 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TBX1O43435 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBX1O43435 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX1O43435 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX1O43435 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX1O43435 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX1O43435 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TBX1O43435 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TBX1O43435 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX1O43435 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX1O43435 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX1O43435 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TBX1O43435 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX1O43435 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX1O43435 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX1O43435 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX1O43435 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX1O43435 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX1O43435 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX1O43435 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TBX1O43435 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBX1O43435 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBX1O43435 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TBX1O43435 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TBX1O43435 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TBX1O43435 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TBX1O43435 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TBX1O43435 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX1O43435 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX1O43435 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TBX1O43435 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX1O43435 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX1O43435 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX1O43435 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX1O43435 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX1O43435 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX1O43435 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms