Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRGAP3O43295 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SRGAP3O43295 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.1 ms