Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPINT1O43278 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPINT1O43278 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms