Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRXO43186 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRXO43186 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRXO43186 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRXO43186 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRXO43186 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRXO43186 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRXO43186 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRXO43186 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRXO43186 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRXO43186 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRXO43186 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRXO43186 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRXO43186 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRXO43186 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRXO43186 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRXO43186 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRXO43186 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRXO43186 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CRXO43186 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CRXO43186 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRXO43186 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRXO43186 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRXO43186 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRXO43186 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRXO43186 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRXO43186 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRXO43186 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRXO43186 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CRXO43186 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CRXO43186 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRXO43186 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRXO43186 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRXO43186 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRXO43186 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRXO43186 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRXO43186 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRXO43186 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRXO43186 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRXO43186 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CRXO43186 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRXO43186 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRXO43186 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRXO43186 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRXO43186 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CRXO43186 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRXO43186 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRXO43186 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRXO43186 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRXO43186 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRXO43186 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRXO43186 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRXO43186 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CRXO43186 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRXO43186 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRXO43186 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRXO43186 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRXO43186 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CRXO43186 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRXO43186 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRXO43186 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRXO43186 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CRXO43186 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRXO43186 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRXO43186 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRXO43186 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRXO43186 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRXO43186 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRXO43186 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRXO43186 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRXO43186 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CRXO43186 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRXO43186 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRXO43186 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRXO43186 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRXO43186 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRXO43186 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRXO43186 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CRXO43186 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRXO43186 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRXO43186 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CRXO43186 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CRXO43186 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CRXO43186 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CRXO43186 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms