Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 C8G-202ENST00000371634 567 ntTSL 313.2□□□□□ -0.32e-9■■■■■ 29.1
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PRPF4O43172 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.048e-8■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.28e-8■■■■■ 29.1
PRPF4O43172 OSBPL2-202ENST00000358053 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.748e-8■■■■■ 29.1
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PRPF4O43172 SPATS2L-220ENST00000457757 835 ntTSL 517.19■□□□□ 0.345e-9■■■■■ 29.1
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PRPF4O43172 EPN1-207ENST00000591743 593 ntTSL 418.55■□□□□ 0.564e-8■■■■■ 29
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PRPF4O43172 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 29
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PRPF4O43172 STAU2-203ENST00000518502 687 ntTSL 310.62□□□□□ -0.719e-8■■■■■ 28.7
PRPF4O43172 STAU2-214ENST00000521451 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.749e-8■■■■■ 28.7
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PRPF4O43172 STAU2-226ENST00000524104 2173 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.119e-8■■■■■ 28.7
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PRPF4O43172 STAU2-211ENST00000521293 552 ntTSL 43.59□□□□□ -1.839e-8■■■■■ 28.7
PRPF4O43172 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.849e-8■■■■■ 28.7
PRPF4O43172 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.919e-8■■■■■ 28.7
PRPF4O43172 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.227e-9■■■■■ 28.7
PRPF4O43172 TCEA3-203ENST00000450454 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.557e-9■■■■■ 28.7
PRPF4O43172 MST1-218ENST00000494809 859 ntTSL 314.91□□□□□ -0.021e-8■■■■■ 28.7
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