Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP8O43159 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP8O43159 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP8O43159 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP8O43159 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP8O43159 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP8O43159 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP8O43159 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP8O43159 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP8O43159 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP8O43159 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP8O43159 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP8O43159 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP8O43159 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP8O43159 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP8O43159 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP8O43159 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP8O43159 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP8O43159 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP8O43159 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP8O43159 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP8O43159 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP8O43159 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP8O43159 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP8O43159 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP8O43159 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP8O43159 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP8O43159 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP8O43159 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP8O43159 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP8O43159 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP8O43159 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RRP8O43159 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP8O43159 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP8O43159 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP8O43159 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP8O43159 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRP8O43159 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP8O43159 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP8O43159 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP8O43159 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP8O43159 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP8O43159 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRP8O43159 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP8O43159 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP8O43159 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRP8O43159 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP8O43159 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP8O43159 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP8O43159 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP8O43159 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP8O43159 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP8O43159 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP8O43159 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP8O43159 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP8O43159 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP8O43159 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP8O43159 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRP8O43159 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP8O43159 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP8O43159 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP8O43159 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP8O43159 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP8O43159 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP8O43159 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP8O43159 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP8O43159 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP8O43159 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP8O43159 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP8O43159 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP8O43159 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP8O43159 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP8O43159 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP8O43159 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP8O43159 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP8O43159 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP8O43159 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP8O43159 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP8O43159 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP8O43159 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP8O43159 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP8O43159 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP8O43159 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP8O43159 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP8O43159 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP8O43159 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP8O43159 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP8O43159 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP8O43159 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP8O43159 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP8O43159 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP8O43159 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP8O43159 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP8O43159 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP8O43159 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP8O43159 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP8O43159 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP8O43159 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP8O43159 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP8O43159 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms