Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC3O15379 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC3O15379 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC3O15379 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms