Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CITO14578 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CITO14578 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CITO14578 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CITO14578 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CITO14578 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CITO14578 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CITO14578 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CITO14578 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CITO14578 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CITO14578 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CITO14578 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CITO14578 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CITO14578 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CITO14578 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CITO14578 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CITO14578 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CITO14578 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CITO14578 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CITO14578 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CITO14578 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CITO14578 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CITO14578 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CITO14578 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CITO14578 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CITO14578 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CITO14578 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CITO14578 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CITO14578 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CITO14578 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CITO14578 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CITO14578 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CITO14578 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CITO14578 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CITO14578 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CITO14578 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CITO14578 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CITO14578 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CITO14578 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CITO14578 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CITO14578 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CITO14578 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CITO14578 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CITO14578 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CITO14578 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CITO14578 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CITO14578 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CITO14578 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CITO14578 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CITO14578 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CITO14578 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CITO14578 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CITO14578 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CITO14578 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CITO14578 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CITO14578 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CITO14578 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CITO14578 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CITO14578 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CITO14578 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CITO14578 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CITO14578 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CITO14578 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CITO14578 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CITO14578 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CITO14578 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CITO14578 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CITO14578 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CITO14578 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CITO14578 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CITO14578 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CITO14578 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CITO14578 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CITO14578 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CITO14578 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CITO14578 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CITO14578 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CITO14578 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CITO14578 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CITO14578 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CITO14578 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CITO14578 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CITO14578 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CITO14578 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CITO14578 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CITO14578 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CITO14578 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CITO14578 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CITO14578 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CITO14578 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CITO14578 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CITO14578 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CITO14578 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CITO14578 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CITO14578 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CITO14578 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CITO14578 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CITO14578 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CITO14578 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CITO14578 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms