Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SMOX-208ENST00000484515 900 ntTSL 325.11■■□□□ 1.615e-11■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.65e-11■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.355e-11■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 SMOX-210ENST00000493223 280 ntTSL 311.87□□□□□ -0.515e-11■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.323e-16■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 TRAPPC10-203ENST00000422875 5267 ntTSL 1 (best)18.28■□□□□ 0.523e-16■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.153e-16■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 HIF1AN-203ENST00000526476 708 ntTSL 319.49■□□□□ 0.711e-9■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 HIF1AN-205ENST00000533589 1042 ntTSL 311.79□□□□□ -0.521e-9■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.491e-9■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 ILK-213ENST00000534565 574 ntTSL 213.61□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 51.2
DDX3XO00571 MPZL1-207ENST00000465787 1305 ntTSL 1 (best)25.24■■□□□ 1.631e-15■■■■■ 51.1
DDX3XO00571 MPZL1-205ENST00000448405 1596 ntTSL 1 (best)24.69■■□□□ 1.541e-15■■■■■ 51.1
DDX3XO00571 MPZL1-206ENST00000464954 607 ntTSL 221.9■■□□□ 1.11e-15■■■■■ 51.1
DDX3XO00571 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.921e-15■■■■■ 51.1
DDX3XO00571 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.151e-15■■■■■ 51.1
DDX3XO00571 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.441e-14■■■■■ 51.1
DDX3XO00571 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.051e-14■■■■■ 51.1
DDX3XO00571 BRI3-202ENST00000456357 667 ntTSL 218.17■□□□□ 0.51e-14■■■■■ 51.1
DDX3XO00571 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.434e-12■■■■■ 51.1
DDX3XO00571 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.031e-19■■■■■ 51
DDX3XO00571 TOR1A-202ENST00000473084 1668 ntTSL 1 (best)21.03■□□□□ 0.961e-19■■■■■ 51
DDX3XO00571 WDR11-213ENST00000605202 651 ntTSL 417.53■□□□□ 0.46e-11■■■■■ 51
DDX3XO00571 WDR11-212ENST00000605178 565 ntTSL 414.69□□□□□ -0.066e-11■■■■■ 51
DDX3XO00571 WDR11-216ENST00000605543 3010 ntTSL 211.46□□□□□ -0.576e-11■■■■■ 51
DDX3XO00571 WDR11-211ENST00000605069 558 ntTSL 411.38□□□□□ -0.596e-11■■■■■ 51
DDX3XO00571 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.896e-11■■■■■ 51
DDX3XO00571 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.457e-11■■■■■ 50.8
DDX3XO00571 AP1B1-210ENST00000473606 560 ntTSL 219■□□□□ 0.632e-12■■■■■ 50.8
DDX3XO00571 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.012e-12■■■■■ 50.8
DDX3XO00571 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.042e-12■■■■■ 50.8
DDX3XO00571 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.12e-12■■■■■ 50.8
DDX3XO00571 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-12■■■■■ 50.8
DDX3XO00571 RNF130-204ENST00000520911 1790 ntTSL 1 (best)29.86■■■□□ 2.379e-33■■■■■ 50.8
DDX3XO00571 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.259e-33■■■■■ 50.8
DDX3XO00571 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.199e-33■■■■■ 50.8
DDX3XO00571 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.559e-33■■■■■ 50.8
DDX3XO00571 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.662e-18■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.62e-18■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.52e-18■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 SLC35B2-203ENST00000495706 1859 ntTSL 324.42■■□□□ 1.52e-18■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.852e-18■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.042e-18■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 TINAGL1-207ENST00000478398 765 ntTSL 320.24■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 TINAGL1-205ENST00000466998 680 ntTSL 219.37■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 TINAGL1-203ENST00000461030 820 ntTSL 518.92■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 LINC01226-204ENST00000639839 554 ntTSL 413.94□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 LINC01226-207ENST00000640226 551 ntTSL 412.48□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.283e-69■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 MCAM-211ENST00000529295 757 ntTSL 419.25■□□□□ 0.679e-14■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 MCAM-206ENST00000526992 574 ntTSL 416.87■□□□□ 0.299e-14■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.228e-7■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 MCAM-210ENST00000529257 563 ntTSL 514.56□□□□□ -0.089e-14■■■■■ 50.7
DDX3XO00571 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.798e-11■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.058e-11■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.168e-11■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.283e-21■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 UBOX5-203ENST00000449731 524 ntTSL 515.8■□□□□ 0.123e-21■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 UBOX5-202ENST00000348031 4469 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.293e-21■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 UBOX5-201ENST00000217173 4631 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.473e-21■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-216ENST00000522925 559 ntTSL 411.69□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-215ENST00000522903 556 ntTSL 411.69□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-202ENST00000517540 1753 ntTSL 311.42□□□□□ -0.586e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-208ENST00000519792 567 ntTSL 410.83□□□□□ -0.686e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.686e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-213ENST00000521617 774 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-220ENST00000524037 865 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-218ENST00000523375 646 ntTSL 38.31□□□□□ -1.086e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.356e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.486e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.486e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.616e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.636e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.646e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.796e-7■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.581e-31■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 HSPB11-205ENST00000488884 463 ntTSL 25.36□□□□□ -1.551e-31■■■■■ 50.6
DDX3XO00571 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.944e-21■■■■■ 50.5
DDX3XO00571 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.174e-21■■■■■ 50.5
DDX3XO00571 C12orf49-202ENST00000547606 492 ntTSL 313.83□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 TMEM39B-205ENST00000468135 1834 ntTSL 518.81■□□□□ 0.63e-10■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 TMEM39B-204ENST00000466321 770 ntTSL 518.79■□□□□ 0.63e-10■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 TMEM39B-203ENST00000441402 1538 ntTSL 1 (best)18.32■□□□□ 0.523e-10■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.493e-10■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.243e-10■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 TMEM39B-202ENST00000438825 690 ntTSL 516.09■□□□□ 0.173e-10■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 TMEM39B-206ENST00000472503 950 ntTSL 313.67□□□□□ -0.223e-10■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 TMEM39B-208ENST00000487305 2087 ntTSL 213.47□□□□□ -0.253e-10■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 HIST1H4H-201ENST00000377727 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.752e-58■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 HIST1H4H-204ENST00000635491 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.762e-58■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 HIST1H4H-202ENST00000634560 1034 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.762e-58■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.071e-28■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 HIST1H4H-203ENST00000634956 2163 ntTSL 58.31□□□□□ -1.082e-58■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 KBTBD2-202ENST00000423022 556 ntTSL 35.58□□□□□ -1.523e-10■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 CTBS-203ENST00000465118 1748 ntTSL 523.18■■□□□ 1.32e-14■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.279e-32■■■■■ 50.4
DDX3XO00571 CLIC4-204ENST00000497755 672 ntTSL 321.55■■□□□ 1.041e-21■■■■■ 50.4
Retrieved 100 of 47,714 protein–RNA pairs in 1762.2 ms