Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
O00370 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
O00370 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
O00370 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
O00370 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
O00370 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
O00370 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
O00370 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
O00370 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
O00370 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
O00370 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
O00370 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
O00370 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
O00370 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
O00370 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
O00370 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
O00370 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
O00370 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
O00370 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
O00370 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
O00370 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
O00370 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
O00370 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
O00370 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
O00370 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
O00370 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
O00370 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
O00370 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
O00370 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
O00370 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
O00370 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
O00370 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
O00370 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
O00370 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
O00370 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
O00370 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
O00370 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
O00370 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
O00370 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
O00370 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
O00370 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
O00370 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
O00370 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
O00370 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
O00370 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
O00370 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
O00370 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
O00370 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
O00370 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
O00370 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
O00370 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
O00370 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
O00370 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
O00370 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
O00370 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
O00370 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
O00370 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
O00370 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
O00370 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
O00370 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
O00370 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
O00370 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
O00370 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
O00370 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
O00370 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
O00370 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
O00370 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
O00370 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
O00370 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
O00370 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
O00370 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
O00370 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
O00370 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
O00370 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
O00370 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
O00370 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
O00370 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
O00370 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
O00370 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
O00370 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
O00370 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
O00370 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
O00370 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
O00370 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
O00370 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
O00370 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
O00370 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
O00370 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
O00370 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
O00370 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
O00370 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
O00370 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
O00370 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
O00370 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
O00370 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
O00370 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
O00370 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
O00370 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
O00370 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
O00370 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms