Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIK3CDO00329 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIK3CDO00329 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3CDO00329 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3CDO00329 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms