Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AGRPO00253 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGRPO00253 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGRPO00253 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGRPO00253 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AGRPO00253 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AGRPO00253 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGRPO00253 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGRPO00253 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGRPO00253 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGRPO00253 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AGRPO00253 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGRPO00253 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AGRPO00253 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGRPO00253 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGRPO00253 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGRPO00253 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGRPO00253 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGRPO00253 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGRPO00253 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AGRPO00253 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGRPO00253 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGRPO00253 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGRPO00253 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGRPO00253 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGRPO00253 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGRPO00253 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGRPO00253 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AGRPO00253 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGRPO00253 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGRPO00253 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGRPO00253 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGRPO00253 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGRPO00253 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGRPO00253 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGRPO00253 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGRPO00253 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGRPO00253 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGRPO00253 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGRPO00253 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGRPO00253 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGRPO00253 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGRPO00253 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGRPO00253 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGRPO00253 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGRPO00253 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGRPO00253 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGRPO00253 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGRPO00253 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGRPO00253 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGRPO00253 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AGRPO00253 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGRPO00253 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGRPO00253 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGRPO00253 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGRPO00253 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGRPO00253 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGRPO00253 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGRPO00253 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGRPO00253 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGRPO00253 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGRPO00253 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGRPO00253 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGRPO00253 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGRPO00253 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGRPO00253 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGRPO00253 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGRPO00253 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGRPO00253 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGRPO00253 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGRPO00253 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGRPO00253 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGRPO00253 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGRPO00253 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AGRPO00253 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGRPO00253 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGRPO00253 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGRPO00253 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGRPO00253 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGRPO00253 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGRPO00253 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGRPO00253 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AGRPO00253 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGRPO00253 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGRPO00253 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGRPO00253 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGRPO00253 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGRPO00253 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGRPO00253 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGRPO00253 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGRPO00253 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGRPO00253 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGRPO00253 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGRPO00253 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGRPO00253 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGRPO00253 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGRPO00253 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGRPO00253 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGRPO00253 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGRPO00253 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms