Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVH48-1M5A8F1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVH48-1M5A8F1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms