Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms