Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3E7EW58 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3E7EW58 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRN3E7EW58 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRN3E7EW58 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3E7EW58 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRN3E7EW58 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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