Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L12C9JPN9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP17L12C9JPN9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L12C9JPN9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L12C9JPN9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L12C9JPN9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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