Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2CD4DB7Z1M9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C2CD4DB7Z1M9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2CD4DB7Z1M9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms