Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4E171 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4E171 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4E171 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B4E171 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4E171 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4E171 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4E171 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4E171 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4E171 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4E171 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4E171 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4E171 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4E171 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4E171 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4E171 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4E171 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4E171 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4E171 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4E171 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
B4E171 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4E171 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
B4E171 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4E171 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4E171 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4E171 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4E171 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4E171 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4E171 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4E171 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4E171 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4E171 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4E171 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4E171 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4E171 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4E171 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4E171 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4E171 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4E171 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4E171 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4E171 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4E171 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4E171 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4E171 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4E171 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4E171 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4E171 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4E171 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4E171 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4E171 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4E171 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
B4E171 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4E171 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4E171 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4E171 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4E171 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4E171 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4E171 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4E171 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4E171 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B4E171 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4E171 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4E171 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4E171 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4E171 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4E171 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4E171 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4E171 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4E171 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4E171 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4E171 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4E171 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4E171 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4E171 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4E171 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4E171 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
B4E171 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4E171 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
B4E171 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4E171 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4E171 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4E171 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
B4E171 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
B4E171 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
B4E171 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
B4E171 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
B4E171 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4E171 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4E171 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4E171 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4E171 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4E171 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4E171 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4E171 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4E171 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4E171 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4E171 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4E171 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B4E171 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
B4E171 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms