Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L5A8MUK1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L5A8MUK1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L5A8MUK1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L5A8MUK1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms