Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MEIS3P2A8K0S8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MEIS3P2A8K0S8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MEIS3P2A8K0S8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms