Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOBPA7XYQ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOBPA7XYQ1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOBPA7XYQ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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