Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4orf47A7E2U8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4orf47A7E2U8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4orf47A7E2U8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms