Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCNX2A6NKB5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCNX2A6NKB5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCNX2A6NKB5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms