Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW4

LRRC3C, Leucine-rich repeat-containing protein 3C, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3CA6NJW4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC3CA6NJW4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRC3CA6NJW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC3CA6NJW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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