Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC69A6NI79 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC69A6NI79 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC69A6NI79 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms