Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEF25A6NGN4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF25A6NGN4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF25A6NGN4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms