Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLCD2A6NGC4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TLCD2A6NGC4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD2A6NGC4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD2A6NGC4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD2A6NGC4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD2A6NGC4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD2A6NGC4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TLCD2A6NGC4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD2A6NGC4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD2A6NGC4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD2A6NGC4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD2A6NGC4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD2A6NGC4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TLCD2A6NGC4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms