Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MEIS3P1A6NDR6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MEIS3P1A6NDR6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MEIS3P1A6NDR6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms