Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GMNCA6NCL1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GMNCA6NCL1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMNCA6NCL1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms