Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS37CA5D8V6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.54■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.52■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS37CA5D8V6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS37CA5D8V6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms