Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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