Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIPT1Q9Y234 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms