Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms