Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNX7Q9UNH6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms